人力资源部颁发康复理疗师资格证与卫生部康复理疗师证书之间主要有以下三点区别：
1、资格认定的区别。人力资源部颁发康复理疗师资格证是对职业技能进行认定，属于职业技能证书。卫生部康复理疗师证书在医疗卫生系统通用，且全社会认可，是一个资格证书。
2、工作范围有区别。卫生部康复理疗师证书除了康复医学类项目，其它理疗项目都可以进行，但没有处方权。人力资源部颁发的康复理疗师资格证主要是理疗仪器类项目。
3、工作地点上有区别。拿到卫生部康复理疗师证书可以在医院康复科，卫生保健机构，体育局的体训队等地工作。取得人力资源部颁发的康复理疗师资格证后主要在康复中心工作。
